Frère prêcheur à l'abbaye de Saint-Maximin, il est ordonné prêtre en 1949, année de la soutenance de sa thèse de doctorat sur Richard de Saint-Victor. Il enseigne l'histoire de l'Eglise à Saint-Maximin. A la fermeture du couvent, en 1957, il est assigné à celui de Marseille et rejoint le groupe de recherche que dirige Georges Duby à la faculté des lettres d'Aix.. Cette collaboration va durer trente-cinq ans.
En 1967, le Père Amargier soutient une thèse sur des Chartes inédites de Saint Victor de Marseille (XIe-XIIe siècles). La plupart de ses travaux concernent l'histoire de la Provence du Xe au XIVe siècle. Leur liste comprend des dizaines d'ouvrages, mémoires et communications. Elle montre la finesse d’analyse de leur auteur, son érudition, ses compétences en latin, en numismatique, sigillographie, paléographie et en bien d'autres disciplines dont la connaissance est nécessaire à l'historien.
[Extrait de la généalogie du fauteuil 29 de M. Henri Tachoire]